Dr. rer. medic. Herbert Schulz
Dr. rer. medic. Herbert Schulz
AG Bioinformatik in der Weltraummedizin
2024
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The formation of stable lung tumor spheroids during random positioning involves increased estrogen sensitivity
In: Biomolecules - Basel : MDPI, Bd. 14 (2024), Heft 10, Artikel 1292, insges. 17 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Structural and molecular changes of human chondrocytes exposed to the rotating wall vessel bioreactor
In: Biomolecules - Basel : MDPI, Bd. 14 (2024), Heft 1, Artikel 25, insges. 24 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Omics studies of tumor cells under microgravity conditions
In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 25 (2024), Heft 2, Artikel 926, insges. 48 S.
2023
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Effects of high glucose on human endothelial cells exposed to simulated microgravity
In: Biomolecules - Basel : MDPI, Bd. 13 (2023), Heft 2, Artikel 189, insges. 22 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Current knowledge about the impact of microgravity on gene regulation
In: Cells - Basel : MDPI, Bd. 12 (2023), Heft 7, Artikel 1043, insges. 59 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A systematic review of the effect of vericiguat on patients with heart failure
In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 24 (2023), Heft 14, Artikel 11826, insges. 18 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Long-term simulation of microgravity induces changes in gene expression in breast cancer cells
In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 24 (2023), Heft 2, Artikel 1181, insges. 23 S.
2022
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Benchmarking of univariate pleiotropy detection methods applied to epilepsy
In: Human mutation - New York, NY [u.a.]: Wiley-Liss, 1992, Bd. 43 (2022), 9, S. 1314-1332
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Microgravity-related changes in bone density and treatment options - a systematic review
In: International journal of molecular sciences - Basel: Molecular Diversity Preservation International, 2000, Bd. 23 (2022), 15, insges. 23 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Prolonged exposure to simulated microgravity changes release of small extracellular vesicle in breast cancer cells
In: International journal of molecular sciences - Basel: Molecular Diversity Preservation International, 2000, Bd. 23 (2022), 24, insges. 20 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A versatile clustered regularly interspaced palindromic repeats toolbox to study neurological CaV3.2 channelopathies by promoter-mediated transcription control
In: Frontiers in molecular neuroscience - Lausanne : Frontiers Research Foundation, Bd. 14 (2022), Artikel 667143, insges. 9 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Three-dimensional growth of prostate cancer cells exposed to simulated microgravity
In: Frontiers in cell and developmental biology - Lausanne : Frontiers Media, Bd. 10 (2022), Artikel 841017, insges. 21 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The fight against cancer by microgravity - the multicellular spheroid as a metastasis model
In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 23 (2022), Heft 6, Artikel 3073, insges. 45 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Latest knowledge about changes in the proteome in microgravity
In: Expert review of proteomics - Abingdon : Taylor & Francis Group, Bd. 19 (2022), Heft 1, S. 43-59
Begutachteter Zeitschriftenartikel
In prostate cancer cells cytokines are early responders to gravitational changes occurring in parabolic flights
In: International journal of molecular sciences - Basel: Molecular Diversity Preservation International, 2000, Bd. 23 (2022), 14, insges. 18 S.
2021
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Gene expression analysis in epileptic hippocampi reveals a promoter haplotype conferring reduced aldehyde dehydrogenase 5a1 expression and responsiveness
In: In: Epilepsia, Blackwell Publishing Inc., Bd. 62, 1, S. e29-e34, 2021, 00139580
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Interaction network provides clues on the role of BCAR1 in cellular response to changes in gravity
In: Computation - Basel: MDPI, 2013, Bd. 9 (2021), 8, insges. 25 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The CellBox-2 Mission to the International Space Station - thyroid cancer cells in space
In: International journal of molecular sciences - Basel: Molecular Diversity Preservation International, 2000, Bd. 22 (2021), 16, insges. 21 S.
2020
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Pharmacoresponse in genetic generalized epilepsy: a genome-wide association study.
In: Pharmacogenomics, Bd. 21, Heft 5, S. 325-335, unter URL: https://dx.doi.org/10.2217/pgs-2019-0179, unter URL: 10.2217/pgs-2019-0179
2019
Begutachteter Zeitschriftenartikel
No evidence for a BRD2 promoter hypermethylation in blood leukocytes of Europeans with juvenile myoclonic epilepsy.
In: Epilepsia, Bd. 60, Heft 5, S. e31-e36, unter URL: https://dx.doi.org/10.1111/epi.14657, unter URL: 10.1111/epi.14657
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Linkage Evidence for a Two-Locus Inheritance of LQT-Associated Seizures in a Multigenerational LQT Family With a Novel KCNQ1 Loss-of-Function Mutation.
In: Frontiers in neurology, Bd. 10, S. 648, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31293497
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Beneficial effects of low frequency vibration on human chondrocytes in vitro
In: Cellular physiology and biochemistry - Düsseldorf: Cell Physiol Biochem Press GmbH & Co KG, Bd. 53 (2019), Heft 4, S. 623-637
2018
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Sox11 gene disruption causes congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT).
In: Kidney international, Bd. 93, Heft 5, S. 1142-1153, unter URL: https://dx.doi.org/10.1016/j.kint.2017.11.026, unter URL: 10.1016/j.kint.2017.11.026
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The role of NF[kappa]B in spheroid formation of human breast cancer cells cultured on the Random Positioning Machine
In: Scientific reports - [London]: Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature, 2011, Bd. 8.2018, Art.-Nr. 921, insges. 17 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Thyroid cancer cells in space during the TEXUS-53 sounding rocket mission - the THYROID project
In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature - Bd. 8.2018, Art.-Nr. 10355, insges. 13 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Pathway analysis hints towards beneficial effects of long-term vibration on human chondrocytes
In: Cellular physiology and biochemistry - Düsseldorf: Cell Physiol Biochem Press GmbH & Co KG, 1991, Bd. 47 (2018), 4, S. 1729-1741
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Microgravity affects thyroid cancer cells during the TEXUS-53 mission stronger than hypergravity
In: International journal of molecular sciences - Basel: Molecular Diversity Preservation International, 2000, Bd. 19.2018, 12, Art.-Nr. 4001, insges. 20 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
An N-Ethyl-N-Nitrosourea (ENU)-Induced Tyr265Stop Mutation of the DNA Polymerase Accessory Subunit Gamma 2 (Polg2) Is Associated With Renal Calcification in Mice.
In: Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research, Bd. 34, Heft 3, S. 497-507, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30395686
Artikel in Kongressband
The effects of long-term vibration on human chondrocytes
In: Involving everyone / International Astronautical Congress , 2018 - Red Hook, NY : Curran Associates, Inc., Artikel IAC-18,A2,7,11,x46111
2017
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Expression profiling of colorectal cancer cells reveals inhibition of DNA replication licensing by extracellular calcium.
In: Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research, Bd. 1864, Heft 6, S. 987-996, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28161520
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Homozygous mutation in TXNRD1 is associated with genetic generalized epilepsy.
In: Free radical biology & medicine, Bd. 106, S. 270-277, unter URL: https://dx.doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2017.02.040, unter URL: 10.1016/j.freeradbiomed.2017.02.040
Begutachteter Zeitschriftenartikel
De novo 8p23.1 deletion in a patient with absence epilepsy.
In: Epileptic disorders : international epilepsy journal with videotape, Bd. 19, Heft 2, S. 217-221, unter URL: https://dx.doi.org/10.1684/epd.2017.0906, unter URL: 10.1684/epd.2017.0906
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Disturbed Placental Imprinting in Preeclampsia Leads to Altered Expression of DLX5, a Human-Specific Early Trophoblast Marker.
In: Circulation, Bd. 136, Heft 19, S. 1824-1839, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28904069
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Genome-wide mapping of genetic determinants influencing DNA methylation and gene expression in human hippocampus.
In: Nature communications, Bd. 8, Heft 1, S. 1511, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29142228
2016
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Adverse left ventricular remodeling by glycoprotein nonmetastatic melanoma protein B in myocardial infarction.
In: FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology, Bd. 31, Heft 2, S. 556-568, unter URL: https://dx.doi.org/10.1096/fj.201600613R, unter URL: 10.1096/fj.201600613R
2015
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Novel candidate genes for impaired nephron development in a rat model with inherited nephron deficit and albuminuria
In: In: Clin Exp Pharmacol Physiol, Bd. 42, 10, S. 1051-1058, 2015
Begutachteter Zeitschriftenartikel
PDE3A mutations cause autosomal dominant hypertension with brachydactyly
In: In: Nat Genet, Bd. 47, 6, S. 647-653, 2015
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Burden analysis of rare microdeletions suggests a strong impact of neurodevelopmental genes in genetic generalised epilepsies
In: In: PLoS Genet, Bd. 11, 5, S. e1005226, 2015
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Alternatively spliced isoforms of WT1 control podocyte-specific gene expression
In: In: Kidney Int, Bd. 88, 2, S. 321-331, 2015
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Differential gene expression of human chondrocytes cultured under short-term altered gravity conditions during parabolic flight maneuvers
In: Cell communication and signaling - London: Biomed Central, Bd. 13.2015, Art.-Nr. 18, insges. 13 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Gene repositioning within the cell nucleus is not random and is determined by its genomic neighborhood
In: In: Epigenetics Chromatin, Bd. 8, S. 36, 2015
2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Differential gene expression profile and altered cytokine secretion of thyroid cancer cells in space
In: The FASEB Journal, Wiley, 2014, Bd. 28, Heft 2, S. 813-835
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Genomes and phenomes of a population of outbred rats and its progenitors
In: In: Sci Data, Bd. 1, S. 140011, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Erratum: Genomes and phenomes of a population of outbred rats and its progenitors
In: In: Sci Data, Bd. 1, S. 140016, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Rosuvastatin can block pro-inflammatory actions of transgenic human C-reactive protein without reducing its circulating levels
In: In: Cardiovasc Ther, Bd. 32, 2, S. 59-65, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
TSHZ1-dependent gene regulation is essential for olfactory bulb development and olfaction
In: In: J Clin Invest, Bd. 124, 3, S. 1214-1227, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Inflammation-induced acute phase response in skeletal muscle and critical illness myopathy
In: In: PLoS One, Bd. 9, 3, S. e92048, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Klf4 and Klf5 differentially inhibit mesoderm and endoderm differentiation in embryonic stem cells
In: In: Nat Commun, Bd. 5, S. 3719, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Protease inhibitor 15, a candidate gene for abdominal aortic internal elastic lamina ruptures in the rat
In: In: Physiol Genomics, Bd. 46, 12, S. 418-428, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Functional improvement and maturation of rat and human engineered heart tissue by chronic electrical stimulation
In: In: J Mol Cell Cardiol, Bd. 74, S. 151-161, 2014
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Proteasome inhibition slightly improves cardiac function in mice with hypertrophic cardiomyopathy
In: In: Front Physiol, Bd. 5, S. 484, 2014
2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Combined sequence-based and genetic mapping analysis of complex traits in outbred rats
In: In: Nat Genet, Bd. 45, 7, S. 767-775, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Altered expression of cyclin A 1 in muscle of patients with facioscapulohumeral muscle dystrophy (FSHD-1)
In: In: PLoS One, Bd. 8, 9, S. e73573, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Interfering with Gal-1-mediated angiogenesis contributes to the pathogenesis of preeclampsia
In: In: Proc Natl Acad Sci U S A, Bd. 110, 28, S. 11451-11456, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Activation of the PTHRP/adenylate cyclase pathway promotes differentiation of rat XEN cells into parietal endoderm, whereas Wnt/ß-catenin signaling promotes differentiation into visceral endoderm
In: In: J Cell Sci, Bd. 126, Pt 1, S. 128-138, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Borna disease virus-induced neuronal degeneration dependent on host genetic background and prevented by soluble factors
In: In: Proc Natl Acad Sci U S A, Bd. 110, 5, S. 1899-1904, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Comparative transcriptional profiling of the axolotl limb identifies a tripartite regeneration-specific gene program
In: In: PLoS One, Bd. 8, 5, S. e61352, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Genomic approach to identify factors that drive the formation of three-dimensional structures by EA.hy926 endothelial cells
In: In: PLoS One, Bd. 8, 5, S. e64402, 2013
Begutachteter Zeitschriftenartikel
TLR4, ATF-3 and IL8 inflammation mediator expression correlates with seizure frequency in human epileptic brain tissue
In: In: Seizure, Bd. 22, 8, S. 675-678, 2013
2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Gene expression signatures defining fundamental biological processes in pluripotent, early, and late differentiated embryonic stem cells
In: In: Stem Cells Dev, Bd. 21, 13, S. 2471-2484, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
MWF rats with spontaneous albuminuria inherit a reduced efficiency of nephron induction during early nephrogenesis in comparison to SHR rats
In: In: J Hypertens, Bd. 30, 10, S. 2031-2038, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Wnt/ß-catenin and Bmp signals control distinct sets of transcription factors in cardiac progenitor cells
In: In: Proc Natl Acad Sci U S A, Bd. 109, 27, S. 10921-10926, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
RBM20, a gene for hereditary cardiomyopathy, regulates titin splicing
In: In: Nat Med, Bd. 18, 5, S. 766-773, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Combined RNAi and localization for functionally dissecting long noncoding RNAs
In: In: Nat Methods, Bd. 9, 4, S. 360-362, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Specific gene signatures and pathways in mesodermal cells and their derivatives derived from embryonic stem cells
In: In: Stem Cell Rev Rep, Bd. 8, 1, S. 43-54, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
HOXB4 can enhance the differentiation of embryonic stem cells by modulating the hematopoietic niche
In: In: Stem Cells, Bd. 30, 2, S. 150-160, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Genome-wide linkage meta-analysis identifies susceptibility loci at 2q34 and 13q31.3 for genetic generalized epilepsies
In: In: Epilepsia, Bd. 53, 2, S. 308-318, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A misplaced lncRNA causes brachydactyly in humans
In: In: J Clin Invest, Bd. 122, 11, S. 3990-4002, 2012
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Genome-wide association analysis of genetic generalized epilepsies implicates susceptibility loci at 1q43, 2p16.1, 2q22.3 and 17q21.32
In: In: Hum Mol Genet, Bd. 21, 24, S. 5359-5372, 2012
Originalartikel in begutachteter internationaler Zeitschrift
Short-term weightlessness produced by parabolic flight maneuvers altered gene expression patterns in human endothelial cells
In: The FASEB journal/ Federation of American Societies for Experimental Biology - Bethesda, Md.: FASEB, Bd. 26 (2012), 2, S. 639-655
Originalartikel in begutachteter internationaler Zeitschrift
Gravity-sensitive signaling drives 3-dimensional formation of multicellular thyroid cancer spheroids
In: The FASEB journal/ Federation of American Societies for Experimental Biology - Bethesda, Md.: FASEB, Bd. 26 (2012), 12, S. 5124-5140
2011
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Angiotensin II type 1 receptor antibodies and increased angiotensin II sensitivity in pregnant rats
In: In: Hypertension, Bd. 58, 1, S. 77-84, 2011
Begutachteter Zeitschriftenartikel
RAD21 cooperates with pluripotency transcription factors in the maintenance of embryonic stem cell identity
In: In: PLoS One, Bd. 6, 5, S. e19470, 2011
Originalartikel in begutachteter internationaler Zeitschrift
Differential gene regulation under altered gravity conditions in follicular thyroid cancer cells: relationship between the extracellular matrix and the cytoskeleton
In: Cellular physiology and biochemistry - Basel : Karger, Bd. 28 (2011), Heft 2, S. 185-198
2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Characterization of mouse embryonic stem cell differentiation into the pancreatic lineage in vitro by transcriptional profiling, quantitative RT-PCR and immunocytochemistry
In: In: Int J Dev Biol, Bd. 54, 1, S. 41-54, 2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A trans-acting locus regulates an anti-viral expression network and type 1 diabetes risk
In: In: Nature, Bd. 467, 7314, S. 460-464, 2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A murine model of Denys-Drash syndrome reveals novel transcriptional targets of WT1 in podocytes
In: In: Hum Mol Genet, Bd. 19, 1, S. 1-15, 2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Alpha1A-adrenergic receptor-directed autoimmunity induces left ventricular damage and diastolic dysfunction in rats
In: In: PLoS One, Bd. 5, 2, S. e9409, 2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Global transcriptomic analysis of murine embryonic stem cell-derived brachyury(+) (T) cells
In: In: Genes Cells, Bd. 15, 3, S. 209-228, 2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Clinical and genetic features in a family with CADASIL and high lipoprotein (a) values
In: In: J Neurol, Bd. 257, 8, S. 1240-1245, 2010
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Geno-transcriptomic dissection of proteinuria in the uninephrectomized rat uncovers a molecular complexity with sexual dimorphism
In: In: Physiol Genomics, Bd. 42A, 4, S. 301-316, 2010
2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Novel STAT3 target genes exert distinct roles in the inhibition of mesoderm and endoderm differentiation in cooperation with Nanog
In: In: Stem Cells, Bd. 27, 8, S. 1760-1771, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Somitovasculin, a novel endothelial-specific transcript involved in the vasculature development
In: In: Arterioscler Thromb Vasc Biol, Bd. 29, 11, S. 1823-1829, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Characterization of the phosphoinositide 3-kinase-dependent transcriptome in murine embryonic stem cells: identification of novel regulators of pluripotency
In: In: Stem Cells, Bd. 27, 4, S. 764-775, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A genome-scale RNAi screen for Oct4 modulators defines a role of the Paf1 complex for embryonic stem cell identity
In: In: Cell Stem Cell, Bd. 4, 5, S. 403-415, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Three LIF-dependent signatures and gene clusters with atypical expression profiles, identified by transcriptome studies in mouse ES cells and early derivatives
In: In: BMC Genomics, Bd. 10, S. 73, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Transcriptional profiling of CD31(+) cells isolated from murine embryonic stem cells
In: In: Genes Cells, Bd. 14, 2, S. 243-260, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Functional characterization and transcriptome analysis of embryonic stem cell-derived contractile smooth muscle cells
In: In: Hypertension, Bd. 53, 2, S. 196-204, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The tyrosine phosphatase Shp2 (PTPN11) directs Neuregulin-1/ErbB signaling throughout Schwann cell development
In: In: Proc Natl Acad Sci U S A, Bd. 106, 39, S. 16704-16709, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The FunGenES database: a genomics resource for mouse embryonic stem cell differentiation
In: In: PLoS One, Bd. 4, 9, S. e6804, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Retraction: Mutations in CLCN2 encoding a voltage-gated chloride channel are associated with idiopathic generalized epilepsies
In: In: Nat Genet, Bd. 41, 9, S. 1043, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
CLCN2 variants in idiopathic generalized epilepsy
In: In: Nat Genet, Bd. 41, 9, S. 954-955, 2009
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Neural differentiation of embryonic stem cells in vitro: a road map to neurogenesis in the embryo
In: In: PLoS One, Bd. 4, 7, S. e6286, 2009
2008
Begutachteter Zeitschriftenartikel
SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat
In: In: Nat Genet, Bd. 40, 5, S. 560-566, 2008
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Histone deacetylase inhibition accelerates the early events of stem cell differentiation: transcriptomic and epigenetic analysis
In: In: Genome Biol, Bd. 9, 4, S. R65, 2008
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Soluble epoxide hydrolase is a susceptibility factor for heart failure in a rat model of human disease
In: In: Nat Genet, Bd. 40, 5, S. 529-537, 2008
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Localization of genetic loci controlling hydronephrosis in the Brown Norway rat and its association with hematuria
In: In: Physiol Genomics, Bd. 34, 2, S. 215-224, 2008
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Potential relevance of alpha(1)-adrenergic receptor autoantibodies in refractory hypertension
In: In: PLoS One, Bd. 3, 11, S. e3742, 2008
2007
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Quantitative genetic basis of arterial phenotypes in the Brown Norway rat
In: In: Physiol Genomics, Bd. 30, 1, S. 17-25, 2007
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Variants in a novel epidermal collagen gene (COL29A1) are associated with atopic dermatitis
In: In: PLoS Biol, Bd. 5, 9, S. e242, 2007
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Dysfunction of dysferlin-deficient hearts
In: In: J Mol Med (Berl), Bd. 85, 11, S. 1203-1214, 2007
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Transcriptomic and phenotypic analysis of murine embryonic stem cell derived BMP2+ lineage cells: an insight into mesodermal patterning
In: In: Genome Biol, Bd. 8, 9, S. R184, 2007
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Expression of the protein phosphatase 1 inhibitor KEPI is downregulated in breast cancer cell lines and tissues and involved in the regulation of the tumor suppressor EGR1 via the MEK-ERK pathway
In: In: Biol Chem, Bd. 388, 5, S. 489-495, 2007
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Global transcriptome analysis of murine embryonic stem cell-derived cardiomyocytes
In: In: Genome Biol, Bd. 8, 4, S. R56, 2007
2006
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Hyporesponsiveness to glucocorticoids in mice genetically deficient for the corticosteroid binding globulin
In: In: Mol Cell Biol, Bd. 26, 19, S. 7236-7245, 2006
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Familial chilblain lupus, a monogenic form of cutaneous lupus erythematosus, maps to chromosome 3p
In: In: Am J Hum Genet, Bd. 79, 4, S. 731-737, 2006
2005
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Integrated transcriptional profiling and linkage analysis for identification of genes underlying disease
In: In: Nat Genet, Bd. 37, 3, S. 243-253, 2005
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Increased susceptibility to complement attack due to down-regulation of decay-accelerating factor/CD55 in dysferlin-deficient muscular dystrophy
In: In: J Immunol, Bd. 175, 9, S. 6219-6225, 2005
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Role of endocytosis in cellular uptake of sex steroids
In: In: Cell, Bd. 122, 5, S. 751-762, 2005
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Identification of hypertension-related genes through an integrated genomic-transcriptomic approach
In: In: Circ Res, Bd. 96, 6, S. 617-625, 2005
2004
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A SNP map of the rat genome generated from cDNA sequences
In: In: Science, Bd. 303, 5659, S. 807, 2004
2003
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Interaction between blood pressure quantitative trait loci in rats in which trait variation at chromosome 1 is conditional upon a specific allele at chromosome 10
In: In: Hum Mol Genet, Bd. 12, 4, S. 435-439, 2003
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Genome-wide linkage reveals a locus for human essential (primary) hypertension on chromosome 12p
In: In: Hum Mol Genet, Bd. 12, 11, S. 1273-1277, 2003
Begutachteter Zeitschriftenartikel
The role of Wnk4 in polygenic hypertension: a candidate gene analysis on rat chromosome 10
In: In: Hypertension, Bd. 41, 4, S. 938-942, 2003
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Mutations in CLCN2 encoding a voltage-gated chloride channel are associated with idiopathic generalized epilepsies
In: In: Nat Genet, Bd. 33, 4, S. 527-532, 2003
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Exploration of a putative susceptibility locus for idiopathic generalized epilepsy on chromosome 8p12
In: In: Epilepsia, Bd. 44, 1, S. 32-39, 2003
2002
Begutachteter Zeitschriftenartikel
No evidence for a susceptibility locus for idiopathic generalized epilepsy on chromosome 18q21.1
In: In: Am J Med Genet, Bd. 114, 6, S. 673-678, 2002
Aktuelle Projekte
Künstliche Intelligenz trifft auf die Krebsforschung im Weltraum - als Teil des Verbundvorhaben AIMS (Artificial lntelligence Meets Space) - Acronym - AMCRIS -
Laufzeit: 01.09.2022 bis 31.08.2025
Insgesamt ist unser u¨bergeordnetes Ziel die Ermittlung des Einflusses von µg auf humane
Mammakarzinomzellen mit Fokus auf die Mechanismen des dreidimensionalen Wachstums. Zu dessen Erreichung unterteilt sich das beantragte Forschungsvorhaben in zwei wissenschaftliche und technologische Teilziele:
AMCRIS-AP1: Integration bildanalytischer KI-Verfahren fu¨r die Optimierung der Auswertung von unter s-µg und r-µg aufgenommenen hochauflösenden FLUMIAS Bilddaten. Von der KI-gestu¨tzten Bildanalyse erwarten wir:
1. Identifikation und Tracking von Sphäroiden sowie Identifikation und gesicherte Quantifizierung
intrazellulärer molekularer Strukturen und Organellen
2. Generierung von 3D Sphäroid-Modellen unter Verwendung von FLUMIAS Z-Stack Aufnahmen
3. Eine klare Differenzierung von Präparationsartefakten zu Zell- und Zellcluster-Eigenschaften
AMCRIS-AP2: Projektu¨bergreifende Analyse der unter r- und s-µg gewonnenen RNAseq-Daten unter Einbeziehung von ¨Deep Learning¨ Algorithmen und deren analytische Verknu¨pfung mit generellen und eigenen unter Langzeit-µg ermittelten epigenetischen Daten. Von der KI-gestu¨tzten Datenanalyse erwarten wir:
1. Identifikation von µg-verursachten epigenetischen, transkriptionellen und proteomischen Effekten
2. Differenzierung von µg-verursachten und/oder erkrankungsdiskriminierenden Genklassen
3. Differenzierung von zelltypspezifischen, erkrankungsspezifischen und u¨bergreifenden Effekten.
4. Durch anschließende Interaktionsnetzwerkanalysen erwarten wir eine präzise Abbildung der Signalwege µg-basierter Differenzierung und Veränderung von Tumorzellen.
Durch Kombination der Teilvorhaben AMCRIS-AP1 und AMCRIS-AP2 soll ein physiologisch-biochemisches 3D-Modell der Sphäroid-Bildung als Modell fu¨r die Metastasierung von Tumoren entwickelt werden.
Häufige und pleiotrope genetische Faktoren bei der Epileptogenese
Laufzeit: 01.12.2021 bis 30.11.2024
Bisherige Studien zur Identifizierung von in die Epileptogenese involvierter genetischen Risiko-Loci, haben in der Regel genetische Standard-Risikomodelle verwendet, unter denen diese Varianten wirken, nämlich einzelne häufige Varianten unter einem multiplikativen Modell (GWAS-Studien) oder mehrere Subgruppen seltener Varianten, die zusammen als genetische Last wirken (Exom-Studien). In der 1. Förderperiode haben wir (1) 2 neue Suzeptibilitäts-Loci für GGE identifiziert (NCAM1, MAP3K9), (2) eine aberrante ALDH5A1-Promotorregulation beschrieben und (3, bisher P2) eine BenchmarkingStudie von Methoden zur Pleiotropy-Detektion mit häufigen Varianten durchgeführt und diese Methoden auf GWAS-Datensätze von ILAE2 angewandt. In der 2. Förderperiode werden wir im Projekt P3 parallel verschiedene statistische und bioinformatische Ansätze verfolgen, um epilepsiebezogene genetische Varianten zu identifizieren, die unter nicht-standard Risikomodellen agieren oder solche, die zusätzliche Informationen benötigen, einschließlich externer epigenomischer Daten oder Informationen über verwandte Merkmale, um eine ausreichende Power für ihre erfolgreiche Identifizierung zu erreichen. Dies beinhaltet eine erweiterte Pleiotropie-Detektion, Bayes'sche GWAS, polygene Risk-Scores (PRS) Profiling und verbesserte Epilepsie-Sub-Phänotyp-Abgrenzung, systematische Untersuchung von compound heterozygoten Risikomodellen und von paarweiser Epistase sowie verschiedene Ansätze, die auf transkriptionellen und epigenetischen externen Daten basieren. Wir werden uns auf generalisierte genetische Epilepsien (GGEs) konzentrieren, aber auch fokale Epilepsien (FEs) sowie Entwicklungs- und epileptische Enzephalopathien (DEEs) berücksichtigen. Projekt P3 wird neue Kandidaten-SNPs und -InDels mit P1, P2 und den experimentellen Projekten P4- P8 teilen.
- Keine Daten im Forschungsportal hinterlegt.